中国科学院纳米生物效应与安全性实验室，是我国第一个以纳米材料的健康效应与生物安全性为研究方向的实验室，也是在纳米健康安全领域以及肿瘤纳米技术领域具有重要国际影响力的实验室之一。实验室2001年成立，2008年成为中国科学院重点实验室。  

实验室以纳米物质的生物效应这个新的科学问题为核心,以健康安全的国家需求为导向，针对纳米结构以及纳米尺寸物质与生命过程相互作用所产生的新效应，新现象，新规律，开展纳米材料与毒理学、生物学和医学交叉研究。促进化学物理、生物医学与纳米科学和大科学平台的交叉。发展新的学科生长点。在前沿科技领域开展创新性研究，获取具有自主知识产权的创新成果，培养和凝聚创新性人才，构建高水平实验技术和国际学术交流平台。   

截止2017年底，实验室共有在职职工121人，其中科技人员104人、科技支撑人员17人，包括中国科学院院士2人、研究员30人、副研究员及高级工程师/高级实验师52人。其中，入选国家杰出青年科学基金获得者8人。2017年，实验室在站博士后22人。 

2017年，实验室共有在研项目120余项。其中，牵头承担国家重点研发计划纳米科技专项1项，承担国家重点研发计划子课题7项，重大仪器项目子课题1项；主持国家自然科学基金项目76项，包括基金委创新群体1项，重点项目5项，国家杰出青年科学基金项目3项，国家优秀青年科学基金项目2项；主持中国科学院战略性先导科技专项课题5个；主持北京市项目8项。  

目前实验室面积有3000余平方的专用面积，4748.29万元专用设备（单价大于20万元的实验设备）。此外，实验室依托于两个国家级的大型研究平台：（1）国家纳米中心的纳米检测公共平台，（2）高能所的同步辐射装置公共平台。