近10年来，高能所在国际刊物上发表及被引用的论文数，在全国科研机构中的排序均在10名左右。根据中科院文献情报中心科学前沿分析中心基于高水平文章引用率的分析成果，高能所在物理学领域中国最有学术显示度的20家科研机构中排名第一，在物理学领域中国科研机构（包括大学）的科学贡献指数中排名第一，科学鉴赏力指数排名第二。

1978年至今，共获奖200余项，其中国家自然科学二等奖和科技进步二等奖以上共13项。

l　 国家科技进步特等奖1项

北京正负电子对撞机（1990年）

l　 国家科技进步一等奖1项

北京质子直线加速器（1991年）

l　　国家自然科学一等奖1项

反西格玛负超子的发现（1982年）

l　 国家自然科学二等奖4项

层子模型（1982年）

北京谱仪－τ轻子质量的精确测量（1995年）

ψ（2S）衰变及次生粲夸克偶数物理的实验研究（2001年）

2－5Gev能区正负电子湮没产生强子反应截面（R值）的精确测量（2004年）

l　 国家科技进步二等奖5项

中国科学院万立方米级高空科学气球技术系统（1985年）

北京自由电子激光装置（1995年）

若干计算机网络安全关键技术研究及产品开发（2000年）

阿尔法磁谱仪（AMS）永磁体系统（2000年）

宽波段空间伽马射线暴观测研究及仪器研制（2004年）

l　 国家技术发明奖二等奖1项

同步辐射软X射线多层膜反射率计装置及其应用（2000年）