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计算集群使用简要介绍
 

详细使用方法请参见:高能所计算环境使用手册

第一步:账号申请 

用户首先需要拥有计算环境用户账号后才能使用计算环境资源。账号申请可参见账号申请

第二步:账号登录

登录结点是用户使用计算资源,调试程序、提交作业的唯一接口。用户用申请的账号和密码连接lxslc.ihep.ac.cn

  •  Linux用户,

使用linux系统的用户从自己的linux操作系统的字符终端直接用ssh命令登录lxslc.ihep.ac.cn:

# ssh –l username lxslc

根据提示输入正确密码,即能成功登录进入lxslc机器上的个人账号。

  •  Windows用户

使用windowns操作系统的用户需要安装ssh登录软件,如puttySSH Secure Shell Client 等。

以SSH Secure Shell Client为例来描述连接lxslc.ihep.ac.cn的过程:

a.下载后SSH Secure Shell Client软件,安装成功后运行SshClient.exe文件,将弹出

b.在Host Name一栏里填写”lxslc.ihep.ac.cn”后,用鼠标点击“Connect”按钮。按照屏幕提示输入密码即可成功登录。

第三步:作业提交

1) 准备作业脚本

使用vi或者emacs等编辑器,编辑作业脚本。下面是一个最简单的脚本程序的例子,test.sh:

$ cat test.sh

#!/bin/bash

/bin/hostname

sleep 50

脚本test.sh要做两件事情:获取机器名称,并且休眠50秒钟后结束。

2)提交作业

作业脚本编写好后,可以提交作业。不同用户的作业可以交到不同的作业队列。提交作业使用qsub命令,如下所示:

qsub –q besq test.sh

86221.torqsrv.ihep.ac.cn

Besq是作业队列名称。作业成功提交后,系统将返回一个作业ID,如86222.torqmaui.ihep.ac.cn。如果不指定作业队列名,按照计算环境的缺省设定,作业将被提交到公共队列publicq上,如:

qsub test.sh

86221.torqsrv.ihep.ac.cn

计算环境为不同用户组设置各自的作业的队列,用户可以根据系统设定向指定队列提交作业。Publicq为缺省队列,所有用户都可以向publicq提交作业。

qstat命令可用来查询用户可向哪些队列提交作业。

qstat –Qf

上述命令列出了集群系统中的所有队列及允许提交的用户或用户组

3)查看作业状态

在作业排队或运行期间,可以根据作业ID实时查看作业的运行状态,例如:

$ qstat 86222

Job id      Name       User       Time Use S Queue

---------------- ---------------- ---------------- -------- - -----

86223.torqsrv   test.sh     shijy          0 R publicq 

4)获取作业结果

作业运算结束后,在用户提交作业的目录下将会生成两个文本文件:(1)作业运行信息文件,文件名构成为:作业脚本名+“.o”+作业ID,如test.sh.o86222;(b)作业出错信息文件, 文件名构成为:作业脚本名+“.e”+作业ID, 如test.sh.e86222。

用户可以通过查看这两个文件来确认提交的作业是否运行成功。如果作业失败,也可以通过这两个文件查看作业失败的具体原因。

第四步:退出账号

用户使用”exit”命令即可退出计算环境

$ exit

logout

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